Biokatalytische Entstehung von Sesquiterpenoiden

Research output: ThesisDoctoral thesis

Authors

  • Nils Püth

Research Organisations

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Details

Original languageGerman
QualificationDoctor rerum naturalium
Awarding Institution
Supervised by
  • Ralf Günter Berger, Supervisor
Date of Award22 Jun 2023
Place of PublicationHannover
Publication statusPublished - 2023

Abstract

Aroma compounds play a key role in the food industry, with customers paying increasing attention to sustainability and naturalness. In order to achieve this, focus was put on higher fungi as a source of aroma compounds and enzymes for production and quality improvements of foods. In this study, Cerrena unicolor (Cun) was investigated as a producer of sesquiterpenes. Using sequence alignments, 14 sesquiterpene synthases (STS) were identified in the fungal genome. Ten of them were successfully expressed in Escherichia coli, the enzymes produced and functionally characterized. Using tryptic digestion followed by peptide mass fingerprinting, the predicted protein sequences were confirmed. Sequence alignments revealed STS-type conserved motifs, as well as homologies possibly specific for Cun. To investigate metal ion dependence, two STS were selected, which differed in the total number of products and in the products it self. Using other divalent metal ions than Mg2+ for the cyclization reaction showed that the chosen multiproduct cyclase was more promiscuous than the cyclase producing only one single sesquiterpene. Furthermore, it was shown that agro-industrial side streams can be used for the cultivation of Cun and influence sesquiterpene biosynthesis. Carbohydrate-containing side streams such as potato starch and wheat bran did not have a positive influence on the product yield. However, a significant increase in product yield was demonstrated for the lipid-containing rapeseed press cake. An excess of acetyl-CoA caused by the β-oxidation of respective lipids boosted sesquiterpene production, which was confirmed by the incorporation of 13C-labeled acetate supplemented to the nutrient medium.

Cite this

Biokatalytische Entstehung von Sesquiterpenoiden. / Püth, Nils.
Hannover, 2023. 84 p.

Research output: ThesisDoctoral thesis

Püth, N 2023, 'Biokatalytische Entstehung von Sesquiterpenoiden', Doctor rerum naturalium, Leibniz University Hannover, Hannover. https://doi.org/10.15488/14441
Püth, N. (2023). Biokatalytische Entstehung von Sesquiterpenoiden. [Doctoral thesis, Leibniz University Hannover]. https://doi.org/10.15488/14441
Püth N. Biokatalytische Entstehung von Sesquiterpenoiden. Hannover, 2023. 84 p. doi: 10.15488/14441
Püth, Nils. / Biokatalytische Entstehung von Sesquiterpenoiden. Hannover, 2023. 84 p.
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title = "Biokatalytische Entstehung von Sesquiterpenoiden",
abstract = "Im Rahmen der vorliegenden Arbeit wurde der Basidiomycet Cerrena unicolor (Cun) als Sesquiterpenproduzent untersucht. Im Genom des Pilzes konnten mit Hilfe von Sequenzvergleichen 14 Sesquiterpensynthasen (STS) identifiziert werden. Zehn von ihnen wurden anschlie{\ss}end erfolgreich heterolog in Escherichia coli exprimiert, die Enzyme produziert und funktionell charakterisiert. Mittels tryptischem Verdau und anschlie{\ss}endem peptide mass fingerprinting konnten die vorhergesagten Proteinsequenzen best{\"a}tigt werden. Die Sequenzvergleiche zeigten STS-typische konservierte Motive sowie m{\"o}glicherweise f{\"u}r Cun spezifische Homologien. F{\"u}r die Untersuchung der Metallionenabh{\"a}ngigkeit wurden zwei STS aus Cun gew{\"a}hlt, die sich sowohl in der Anzahl der Produkte, als auch den produzierten Sesquiterpenen selbst unterschieden. Setzte man andere bivalente Metallionen als Mg2+ f{\"u}r die Zyklisierungsreaktion ein, zeigte sich, dass die ausgew{\"a}hlte Multiprodukt-Cyclase promiskuitiver als die Cyclase mit nur einem Sesquiterpen als Produkt reagierte. Weiterhin konnte gezeigt werden, dass agro-industrielle Nebenstr{\"o}me f{\"u}r die Kultivierung von Cun verwendet werden k{\"o}nnen und diese Einfluss auf die Sesquiterpenbiosynthese hatten. Eher kohlenhydratreiche Nebenstr{\"o}me wie Kartoffelst{\"a}rke oder Weizenkleie hatten keinen positiven Einfluss auf die Produktausbeute. F{\"u}r den lipidhaltigen Rapspresskuchen konnte jedoch eine deutliche Erh{\"o}hung der Produktausbeute nachgewiesen werden. Die Hypothese, dass durch β-Oxidation der Lipide ein {\"U}berfluss an Acetyl-CoA die Sesquiterpenproduktion boostet, konnte mittels 13C-markiertem Acetat als Medienzusatz experimentell best{\"a}tigt werden.",
author = "Nils P{\"u}th",
year = "2023",
doi = "10.15488/14441",
language = "Deutsch",
school = "Gottfried Wilhelm Leibniz Universit{\"a}t Hannover",

}

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TY - BOOK

T1 - Biokatalytische Entstehung von Sesquiterpenoiden

AU - Püth, Nils

PY - 2023

Y1 - 2023

N2 - Im Rahmen der vorliegenden Arbeit wurde der Basidiomycet Cerrena unicolor (Cun) als Sesquiterpenproduzent untersucht. Im Genom des Pilzes konnten mit Hilfe von Sequenzvergleichen 14 Sesquiterpensynthasen (STS) identifiziert werden. Zehn von ihnen wurden anschließend erfolgreich heterolog in Escherichia coli exprimiert, die Enzyme produziert und funktionell charakterisiert. Mittels tryptischem Verdau und anschließendem peptide mass fingerprinting konnten die vorhergesagten Proteinsequenzen bestätigt werden. Die Sequenzvergleiche zeigten STS-typische konservierte Motive sowie möglicherweise für Cun spezifische Homologien. Für die Untersuchung der Metallionenabhängigkeit wurden zwei STS aus Cun gewählt, die sich sowohl in der Anzahl der Produkte, als auch den produzierten Sesquiterpenen selbst unterschieden. Setzte man andere bivalente Metallionen als Mg2+ für die Zyklisierungsreaktion ein, zeigte sich, dass die ausgewählte Multiprodukt-Cyclase promiskuitiver als die Cyclase mit nur einem Sesquiterpen als Produkt reagierte. Weiterhin konnte gezeigt werden, dass agro-industrielle Nebenströme für die Kultivierung von Cun verwendet werden können und diese Einfluss auf die Sesquiterpenbiosynthese hatten. Eher kohlenhydratreiche Nebenströme wie Kartoffelstärke oder Weizenkleie hatten keinen positiven Einfluss auf die Produktausbeute. Für den lipidhaltigen Rapspresskuchen konnte jedoch eine deutliche Erhöhung der Produktausbeute nachgewiesen werden. Die Hypothese, dass durch β-Oxidation der Lipide ein Überfluss an Acetyl-CoA die Sesquiterpenproduktion boostet, konnte mittels 13C-markiertem Acetat als Medienzusatz experimentell bestätigt werden.

AB - Im Rahmen der vorliegenden Arbeit wurde der Basidiomycet Cerrena unicolor (Cun) als Sesquiterpenproduzent untersucht. Im Genom des Pilzes konnten mit Hilfe von Sequenzvergleichen 14 Sesquiterpensynthasen (STS) identifiziert werden. Zehn von ihnen wurden anschließend erfolgreich heterolog in Escherichia coli exprimiert, die Enzyme produziert und funktionell charakterisiert. Mittels tryptischem Verdau und anschließendem peptide mass fingerprinting konnten die vorhergesagten Proteinsequenzen bestätigt werden. Die Sequenzvergleiche zeigten STS-typische konservierte Motive sowie möglicherweise für Cun spezifische Homologien. Für die Untersuchung der Metallionenabhängigkeit wurden zwei STS aus Cun gewählt, die sich sowohl in der Anzahl der Produkte, als auch den produzierten Sesquiterpenen selbst unterschieden. Setzte man andere bivalente Metallionen als Mg2+ für die Zyklisierungsreaktion ein, zeigte sich, dass die ausgewählte Multiprodukt-Cyclase promiskuitiver als die Cyclase mit nur einem Sesquiterpen als Produkt reagierte. Weiterhin konnte gezeigt werden, dass agro-industrielle Nebenströme für die Kultivierung von Cun verwendet werden können und diese Einfluss auf die Sesquiterpenbiosynthese hatten. Eher kohlenhydratreiche Nebenströme wie Kartoffelstärke oder Weizenkleie hatten keinen positiven Einfluss auf die Produktausbeute. Für den lipidhaltigen Rapspresskuchen konnte jedoch eine deutliche Erhöhung der Produktausbeute nachgewiesen werden. Die Hypothese, dass durch β-Oxidation der Lipide ein Überfluss an Acetyl-CoA die Sesquiterpenproduktion boostet, konnte mittels 13C-markiertem Acetat als Medienzusatz experimentell bestätigt werden.

U2 - 10.15488/14441

DO - 10.15488/14441

M3 - Dissertation

CY - Hannover

ER -